建厂后，实行党委领导下的厂长负责制。1988年，改革领导体制，实行厂长负责制。全厂实行厂、车间、班组三级管理。厂设厂长1人，负责全面工作；副厂长数人，协助厂长工作；完整的行政机构，从事各方面的具体业务工作。1990年，厂行政机构20个，下属车间8个。

组织机构

　　奎棉1963年至1964年，设立厂长领导下的行政办公室、总务室。行政办公室的工作主要是负责生产、人事、财务、供销、基本建设、计划、技术管理及各项操作规程制定工作。总务办公室主要负责办公用品及职工生活福利工作。1965年2月，工厂正式投人生产，成立前纺车间、后纺车间、机动车间。前纺车间是供应车间，后纺车间是生产成品半成品车间，机动车间是为前纺车间、后纺车间服务的辅助车间。6月，筹建成立织布车间。1969年1月，厂成立革命委员会。设立政工组、生产组、后勤组。全厂学习解放军，实行军队编制，前纺为一连，后纺为二连，织布为三连，机动为四连，运转班为排，小组为班。1973年2月21日，撤销生产组改为生产技术科、供销科、财务科、劳资科。将连队建制恢复原车间编制。实行厂、车间、班组三级管理。1976年，又将后纺络筒拈线工序及织布整、浆、穿工序合并成立准备车间。1980年1月7日，将生产技术科分解为统计计划科、设备科、生产技术科。1982年，成立腈纶车间。是年，行政科室相继成立。1984年7月23日，前纺、细纱改为纱场，将准备、织布、整理改为布场。1987年2月12日，在原色织车间的基础上和一二五团毛巾厂联营成立毛巾车间。1988年7月3日，又将纱场改为前纺车间，细纱车间；将布场改为准备、织布、整理车间。